Вакансия в архиве
Компания больше не ищет сотрудника. Посмотрите похожие предложения
BostonGene

Bioinformatics Software Engineer (Genomics)

@ BostonGene

150,000 - 200,000 ₽/мес на руки

Remote
локация
Москва (м. Павелецкая) или полная удаленка — на выбор.
уровень
Middle-to-Senior
сфера
Продуктовая компания
размер команды
6 - 10 человек

BostonGene — американская BioTech компания. Разрабатывает SaaS платформу для онкологов, которая помогает подбирать противоопухолевые терапии для пациентов, основываясь на молекулярно-генетическом анализе опухоли. Клиенты — ведущие онкологические центры США (MD Anderson, Dana-Farber Cancer Institute, Washington University in St. Louis, Weill Cornell Medicine и другие).

В лаборатории BostonGene в Бостоне разрабатывают, тестируют и валидируют новые протоколы для проведения теста, а также биоинформатические алгоритмы для анализа генетических данных. В 2020 году успешно прошли сертификацию CLIA (Clinical Laboratory Improvement Amendments) и теперь работают с клиническим материалом пациентов для проведения секвенирования и последующего анализа в лаборатории.

Технологии/инструменты

Python/R, Bash, Git, NGS.

Почему рекомендуем

  • Продукт в инновационной сфере IT Healthcare.
  • Возможность создавать продукт, который меняет подход к лечению рака.

Чем предстоит заниматься

  • Улучшение, поддержка существующих pipeline и рабочих процессов секвенирования ДНК, соответствующие рекомендациям CLIA и CAP для клинического анализа NGS.
  • Разработка и проведение анализа для улучшения систем поиска вариантов (germline/somatic), классификации и анализа.
  • Постоянное улучшение и обслуживание существующих pipeline.
  • Разработка алгоритмов, используемых для понимания вариабельности рака посредством анализа данных NGS (WES/WGS), оценка и интеграция сторонних инструментов.
  • Анализ больших данных по сотням и тысячам образцов для оценки точности и производительности алгоритмов коллинга мутаций.
  • Непосредственное взаимодействие с лабораторией для оптимизации и валидации теста.
  • Общение с внешними научными командами.
  • Сотрудничество с учеными и клиницистами в разработке и проведении анализа данных клинического секвенирования опухоли с целью повышения качества лечения.

Кого ищут

  • Знание английского не ниже Intermediate.
  • Детальное мышление для работы с приложениями, которые напрямую влияют на здоровье реальных пациентов.
  • Опыт в использовании version control and source code management systems (e.g. Git).
  • Опыт работы с данными NGS.
  • Свободное владение Python/R, Bash.
  • Самостоятельно и хорошо работает в междисциплинарных командах (не значит, что они вас бросят, но прописывать каждый шаг в задаче они не будут; многие анализы являются уникальными и опыта их исследования в мире нет).

Будет плюсом:

  • Amazon AWS.
  • CI/CD.
  • Docker или другая контейнеризация/виртуализация.
  • Опыт использования workflow менеджеров, напрмер Airflow, Luigi, Nextflow/Arvados.
  • Опыт программирования на C ++/Java.

Что предлагают

  • Опыт работы в отрасли precision medicine.
  • Гибкий рабочий график, возможность работать как в офисе, так и удаленно.
  • Коллектив из выпускников лучших ВУЗов (МФТИ, МГУ, Первый мед, СколТех).
  • Регулярный пересмотр оклада, ДМС, корпоративные скидки.
  • Интересная работа и сложные задачи.
  • Офис в пешей доступности от станции метро Павелецкая (сейчас на удаленном формате работы находится большая часть компании).
Екатерина Титова Senior Recruiter
BostonGene

О компании BostonGene

сфера
Продуктовая компания
инвестиции
Приватное финансирование
размер
201 - 500

BostonGene — стартап в области IT Healthcare, cоздают SAAS платформу поддержки принятия решений в области онкологии для врачей.